肠衣主要用途是用于早餐肠、台湾烤肠、哈尔冰红肠、腊肠、风干肠、小肚、发酵香肠等。

天然肠衣一般保存在木桶中，温度一般在3-10℃为宜，避免存放在潮湿处，最好不要存放在氨制冷冷空中。天然肠衣在使用前要反复漂洗，充分除去肠衣表面的盐分和污物。干制肠衣应用温水浸泡，变软后使用。

胶原蛋白肠衣是肉制品加工当中使用广泛的一种肠衣，它可食用，透气性好，一般以动物皮动物皮的真皮层、肌腱和骨胶原为原料。由于富含胶原蛋白，该肠衣透光性和透气性均较好。胶原蛋白肠衣的性质和天然肠衣相近，但比天然肠衣更易于生产。

由于传统天然肠衣均来自于动物的小肠、大肠、肚、胃及膀胱等，其产量、规格、品级受到天然条件的限制，因而不利于工业化连续生产。胶原蛋白肠衣属于人工肠衣，肠衣的规格、壁厚和长度可以根据生产需要任意选择，使用方便，而且可以直接食用，因而越来越受到食品加工企业的青睐。

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